Libxml eklentisi öntanımlı olarak etkin olup iptal edilmek istenirse --disable-libxml derleme seçeneği kullanılabilir.
Seçimlik olan --with-libxml-dir seçeneği belirtildiği takdirde PHP belirtilen yerdeki libxml kütüphanesiyle derlenir, aksi takdirde kütüphane standart yerlerde aranır. Yapılandırma işlemi libxml kütüphanesini (özellikle xml2-config) bulmak için şu yolu izler:
--with-libxml-dir seçeneğinde belirtilen DiZiN ([DiZiN]/bin/xml2-config)
/usr/local/bin/xml2-config
/usr/bin/xml2-config
xml2-config dosyası --with-libxml-dir ile belirttiğiniz yerde bulunamazsa standart yerlere bakılır.