Teljes inline dokumentációs komment blokkokat (docblock-ok) kell készíteni. A dokumentációs blokkok PEAR-csomagokkal kapcsolatos részletezését lásd a Kézikönyv kódolási szabályainak Példa Fájl és a Fejléc komment blokkok fejezeteiben. További információ a phpDocumentor weboldalán érhető el.

Dokumentálásnál általános szabály, hogy amiről nem kívánunk leírást készíteni ("Nem akarom kipróbálni és dokumentálni..."), arról épphogy érdemes kommentet készíteni, mielőtt elfelejtjük hogyan működik.

Mind a C-stílusú kommentek (/* */), mind a C++ stílusúak (//) használata elfogadott. A Perl/shell-stílusú kommentek használata szigorúan ellenjavallt.