phpDocumentor は、JavaDoc に似た PHP で書かれたスタンドアロンな自動ドキュメント生成ツールです。 PHPDoc との違いは、 非常に高速で、PHP ファイルの非常に幅広い範囲をパースするという点です。 また、11 の HTML テンプレートや Windows ヘルプファイル CHM での出力、 PDF 出力、このマニュアルで使用されているマークアップと互換性がある XML DocBook 形式での出力などを含む多くのカスタマイズ機能を持っています。 加えて、PHPXref によるソースコードのハイライト化やリンクも可能です。