Kun kytket iPodin tietokoneeseen, se näkyy musiikkisoittimessa ja myös tiedostonhallinnassa (Kotikansio-sovellus käynnistimessä). Kappaleiden siirto tulee tehdä musiikkisoittimella - tiedostonhallinnan käyttäminen ei toimi, sillä kappaleet eivät siirry oikeaan kansioon. iPodeissa on nimittäin tietty sijainti kappaleiden tallennukseen, jota musiikkisoitin osaa käyttää, mutta tiedostonhallinta ei.

Odota kunnes kappaleet on varmasti kopioitu kokonaan, ennen kuin irrotat iPodin tietokoneesta. Ennen irrottamista muista myös poistaa laite turvallisesti. Näin varmistutaan, että kaikki kappaleet on kopioitu oikein.

Toinen syy, miksi kappaleet eivät näy iPodissa, on se, että musiikkisoittimesi ei tue tiedostomuotojen muuttamista tietystä tiedostomuodosta toiseen. Jos yrität kopioida kappaletta, joka on sellaisessa tiedostomuodossa, jota iPod ei tue (kuten Ogg Vorbis (.oga) -tiedosto), musiikkisoitin yrittää muuttaa sen iPodin ymmärtämään tiedostomuotoon, kuten MP3:een. Jos sopivaa muuntamisohjelmistoa ei ole asennettu, musiikkisoitin ei pysty muuntamaan tiedostoja, ja näin kopiointi epäonnistuu.