PHP 透明地支持 HTTP cookie。cookie 是一种在远程浏览器端储存数据并以此来跟踪和识别用户的机制。可以用 setcookie() 或 setrawcookie() 函数来设置 cookie。cookie 是 HTTP 标头的一部分，因此 setcookie() 函数必须在其它信息被输出到浏览器前调用，这和对 header() 函数的限制类似。可以使用输出缓冲函数来延迟脚本的输出，直到按需要设置好了所有的 cookie 或者其它 HTTP 标头。
任何从客户端发送的 cookie 将会像 GET 和 POST 数据一样被自动的转换为 PHP 变量，该过程受 register_globals 和 variables_order 两个配置选项的影响。如果希望对一个 cookie 变量设置多个值，则需在 cookie 的名称后加 [] 符号。
在 PHP 4.1.0 及更高版本，自动全局变量数组 $_COOKIE 将总是包含所有从客户端发来的 cookie 数据。在老版本的 PHP 中，当 track_vars 配置选项打开时（此选项自 PHP 4.0.3 后总是打开的），系统为 cookie 设置的数组变量是 $HTTP_COOKIE_VARS。
关于更多细节以及有关浏览器问题的注意事项，参见 setcookie() 和 setrawcookie() 函数。